Szkoła Podstawowa nr 12 im. Michała Kajki w Elblągu jest jednostką organizacyjną Gminy Elbląg. Gospodarka finansowa prowadzona jest na zasadach jednostki budżetowej.
Szkoła mieści się w budynku dwupiętrowym, podpiwniczonym. Budynek połączony jest z budynkiem hali sportowej. Przy szkole znajduje się boisko, plac zabaw oraz tereny zielone.
W budynku szkoły znajdują się:
- sale dydaktyczne, w tym pracownia komputerowa, pracownia językowa, pracownia chemiczna;
- gabinet pedagoga;
- gabinet psychologa;
- biblioteka z czytelnią;
- gabinet profilaktyki zdrowotnej;
- pomieszczenia biurowe, gabinety (gabinet dyrektora, gabinet wicedyrektora, gabinet kierownika gospodarczego, sekretariat, pokój nauczycielski);
- szatnie szkolne;
- archiwum szkolne;
- toalety;
- pomieszczenia gospodarcze;
- system ogrzewania szkoły.